Pondok Salam Quran (PSQ) adalah program Pendidikan penunjang baru untuk siswa SM dan SMX. Sekolah Alam Bogor memiliki tujuan Pendidikan diberbagai aspek yaitu akhlak, logic, kepemimpinan, dan bisnis. Berbagai ragam kegiatan yang diselenggarakan di sekolah dihadirkan unruk menunjang perkembangan aspek tersebut. Untuk lebih menguatkan perkembangan pada aspek akhlak Pondok Salam Quran hadir menjadi komplemen terhadap kurikulum dan program sekolah alam.