Program Sekolah Dasar diperuntukan untuk anak usia 6 tahun – 12 tahun, dengan menitik beratkan pendidikan untuk mencari dan memahami potensi diri. SD Sekolah Alam Bogor telah meluluskan lebih dari 10 angkatan dan saat ini memiliki tiga rombel dalam satu Angkatannya.
Model pembelajaran yang dilakukan di SD Sekolah Alam Bogor telah mengalami berbagai terobosan mengikuti perkembangan zaman. Selain memiliki beragam kegiatan khas sekolah alam, saat ini SD Sekolah Alam Bogor juga menerapkan model pembelajaran terintegrasi dan konstektual dengan kegiatan menyenangkan untuk siswa.Diluar pembelajaran dikelas, siswa pun memiliki beragam kegiatan yang untuk mengembangkan potensinya.